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如何用EXCEL画一张帅气的火山图?

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2019-02-14 11:12
火山图是生物信息学中常见的图表类型之一,其作用是展示差异基因的分布情况,横轴表示差异基因表达变化的倍数(Fold change),一般常取以2为底的对数,表示为log2(FC),而纵轴则表示p-value,亦或是更为严格的筛选标准q-value(又称adjusted p-value),一般常取负的以10为底的对数,表示为-log10(p-value)。常用的火山图绘制方法包括R语言的ggplot2包,芯片测序平台自带的内置软件,亦或是在线工具比如ImageGP (http://www.ehbio.com/ImageGP/index.php/Home/Index/)。相关推文:自从用了它,导师被我的论文图片美哭。如何看懂和绘制火山图?如果你不懂R语言,又不想让自己受到现成的软件作图时受到的格式上的束缚,那么你可以试一试EXCEL! 首先我们得到绘制火山图的原始数据,即包括基因名 ………………………………

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