Nat. Rev. Genet. | 深度学习为种群遗传学带来新机遇

编译 | 于洲今天我们介绍由维也纳大学进化人类学系的Xin Huang与Aigerim Rymbekova发表在《Nature Reviews Genetics》上的工作。在群体遗传学中，各种物种和种群的大规模基因组数据的出现，为利用统计推断来理解驱动遗传多样性的进化力量提供了新的机会。然而，群体基因组学时代在分析大量基因组和变异方面提出了新的挑战。深度学习在涉及大规模数据的众多应用中表现出了最先进的性能。最近，深度学习方法在群体遗传学中得到了广泛的应用，在海量基因组数据集、强大的计算硬件和复杂的深度学习架构的推动下，它们已被用于识别种群结构、推断人口历史和研究自然选择。本文介绍了常见的深度学习架构，并为实现深度学习模型进行群体遗传推断提供了全面的指导。本文还从效率、鲁棒性和可解释性等方面讨论了深度学习在群体遗传学中的应用面 ………………………………