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专栏名称: 弗雷赛斯
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你的态度决定ta的去留:0代码,生信实操系列:GEO数据库数据处理流程一览

弗雷赛斯  · 公众号  · 科研  · 2018-09-20 11:25
最近开始,我们陆续开始向大家介绍利用各种公共数据库来低成本(包括实验成本,时间成本,金钱成本等)发表SCI。比如之前提到过的Oncomine数据库,在没有任何实验数据,这篇近3分的SCI是怎么发表的!?这篇推文中,我们介绍了作者如何利用GEO数据库来发表3分的SCI。其实,GEO数据库能做的远远不仅如此,今天我们来更加详细地介绍我们是如何使用GEO数据库的:基因表达汇编(GEO)计划由NCBI于2000年发起的,致力于建立一个基因表达数据仓库和在线资源,用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。GEO主要包含各种芯片数据,也有少部分测序数据,与TCGA的差别在于TCGA只包含人的数据,而GEO是多物种的,GEO上有各种平台的数据,而TCGA只有测序数据,芯片数据的 ………………………………

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