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Cell Res背靠背 | 重大进展,中国学者首次揭示ALKBH1作为未配对DNA的N6-mA去甲基化酶

iNature  · 公众号  ·  · 2020-02-13 09:00
iNatureDNA的N6-甲基腺嘌呤(N6-mA)是哺乳动物基因组中新兴的表观遗传标记。 N6-mA的水平在早期胚胎发生过程中经历了剧烈的波动,这表明存在活跃的调节作用。2020年2月12日,清华大学李海涛及耶鲁大学Andrew Xiao共同通讯在Cell Research 在线发表题为“Mammalian ALKBH1 serves as an N6-mA demethylase of unpairing DNA”的研究论文,该研究显示了2-氧戊二酸依赖性加氧酶ALKBH1在哺乳动物基因组的未配对区域(例如SIDD,应激诱导的DNA双螺旋失稳区域)中充当N6-mA的去甲基化酶。酶分析研究表明,ALKBH1更喜欢用bubbled和凸起的DNA作为底物,而不是单链(ss-)或双链(ds-)DNA。 ALKBH1的结构研究表明,其“ Flip1”基序具有意想不到的“延伸”构象,这是一个保守的元素,通常在催化中心弯曲以利于其 ………………………………

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