Angew. Chem. Int. Ed. | 利用化学交联解析蛋白质动态变化

大家好，今天给大家分享一篇angew上的文章Decoding Protein Dynamics in Cells Using Chemical Cross-Linking and Hierarchical Analysis，本文通讯作者是来自中科院大连化物所的张丽华研究员与赵群研究员、中国科学院精密测量科学与技术创新研究院的龚洲研究员。蛋白的结构与动态控制了其相互作用与功能，但目前仍有相当多蛋白并没有实验手段测定的结构。目前计算的方法如AlphaFold2能预测蛋白的结构，但因其依赖于已知结构数据库PDB，其预测出的结构只能反映单一静态的结构，缺乏动态信息，并且对于缺乏实验数据的柔性区域预测准度较差。活细胞内的化学交联质谱能提供活体蛋白中残基的距离信息，辅助蛋白结构与其动态变化的预测。本文中作者利用化学交联质谱与分子动力学模拟探究了内在无序蛋白的整体结构。作者考虑蛋白质的活性，在交联剂长度的基础上 ………………………………