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单细胞分析Seurat使用相关的10个问题答疑精选!

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2020-02-24 09:20
NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述))、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集)等内容。作为一个刚刚开始进行单细胞转录组分析的菜鸟,R语言底子没有,有时候除了会copy外,如果你让我写个for循环,我只能cross my fingers。。。。于是我看见了https://satijalab.org/seurat/,Seurat是一个R软件包,设计用于QC、分析和探索单细胞RNA-seq数据。Seurat旨在帮助用户能够识别和解释单细胞转录组学中的的异质性来源,并通过整合各种类型的单细胞 ………………………………

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