近日,中国科学院北京基因组研究所 (国家生物信息中心) 杨运桂研究组、蔡军研究组和中国科学院数学与系统科学研究院张世华研究组合作在Nature Communications 杂志上发表了题为 Spatiotemporal transcriptomic atlas reveals the dynamic characteristics and key regulators of planarian regeneration 的研究论文,绘制了地中海涡虫再生过程中的三维空间转录组图谱和单细胞转录组图谱,系统鉴定了多个再生关键调控因子。 在该研究中,合作团队首先绘制了具有强大再生能力地中海涡虫六个不同再生时期的空间转录组和单细胞转录组图谱,并构建了各类细胞类型和组织类型的空间三维分布模型。通过解析全能干细胞亚群的分化轨迹,鉴定到一类以osr2标记的新多能细胞亚群,并且观察到在辐射处理下,敲低osr2的涡虫出现延迟再生表型。与此同时,为了进一步发掘影响涡虫再生的
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