Nat Methods | 四川大学耿佳/陈路开发新的方法，实时检测20种氨基酸

引言氨基酸的精确鉴定和定量对于许多生物应用至关重要。2024年3月5日，四川大学耿佳及陈路共同通讯在Nature Methods 在线发表题为“Real-time detection of 20 amino acids and discrimination of pathologically relevant peptides with functionalized nanopore”的研究论文，该研究报道了一个铜(II)功能化的耻垢分枝杆菌孔蛋白A (MspA)纳米孔，它具有N91H取代，当结合机器学习算法时，它可以直接识别20种蛋白质原氨基酸。验证精度达到99.1%，信号回收率为30.9%。在纳摩尔范围内证明了氨基酸超灵敏定量的可行性。此外，该系统还能够实时分析两种具有代表性的翻译后修饰(PTMs)，一种非天然氨基酸和十种使用外肽酶合成的肽，包括与阿尔茨海默病和癌症新抗原相关的临床相关肽。值得注意的是，该策略成功地从水解产物中区分出只有一个氨基酸差异的肽，并提供了推断肽序列的可能性。 ………………………………