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WGCNA新手入门笔记(含代码和数据)

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2017-11-21 17:32
加权基因共表达网络分析(WGCNA,Weighted gene co-expression network analysis)是一个很火的生信分析方法,高分文章很多。然而很多童鞋敬而远之,因为它是需要跑代码的。其实,WGCNA用起来也没那么难,今天给大家分享一下新手学习WGCNA的经验、常见问题的解决办法,以及如何理解WGCNA分析流程中的关键点,以达到应用的目的。让大家能够入门WGCNA进行实操是我整理这一学习笔记的最终目的。笔记内容涉及到WGCNA的简介,安装运行,代码解析和灵活变换,跑出的图有什么意义等,准备分3-4次说。WGCNA能够从复杂数据中(N多分组)快速地提取出与样本特征相关的基因共表达模块,以供后续分析。简单地说,它通过计算基因之间的表达相关性,将具有表达相关性的基因聚类到一个 ………………………………

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