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教你画一个掰弯的热图(Heatmap),展示更多的基因表达量

生信石头  · 公众号  ·  · 2019-06-19 22:10
难道,这不像孔雀开屏吗?写在前面组学数据已经泛滥,但是信息的挖掘仍任重道远。顺手的工具,可以节省使用者尽可能多的时间,或者将看起来很复杂,很难以完成的事情,变得非常简单。图形的掰弯,这个是我很久以前已经实现的功能,当然这个功能的灵感(而不是实现逻辑)来至《The Grammer of Graphics》(这本书也是R包ggplot2的实现基础)。图形的掰弯,正如本公众号早前的推文介绍,事实是笛卡尔坐标系像极坐标系转换的过程。坐标的转换是一个事情,而图形的变换是另一个事情,比如矩形要办成中空的扇形等。热图,我已经不止一次谈及,如果早前有关注生信札记公众号的朋友,那么应该知道,TBtools有两个热图功能,Amazing Heatmap和Fancy Heatmap Browser,各有所长。一般用过的人,大部分时候都会觉得真的是Amazing。后者目前似乎用的人不多, ………………………………

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