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插件 | 点点点,基因差异表达分析~几分钟就掌握了

生信石头  · 公众号  ·  · 2021-01-25 21:25
于是,TBtools - RNAseq 全家桶到位!写在前面很久很久以前,TBtools 解决了 RNAseq 数据分析中几个常见问题:基因功能注释,NR,SWISSPROT,GO注释等基因集功能富集分析,GO和KEGG去年,通过插件众筹,我们完成了:公开可获取测序数据 SRA 的信息整理Ascp Wrapper,高速下载测序原始数据SRAtoFastq 格式转换FastQC 测序质量评估Trimmomatics 测序数据清洗Kallisto Wrapper 读段计数与基因表达量估计仔细观察其中,以前和去年做的事情,中间还差一个东西,那就是基因差异表达分析。新插件 DESeq2 Wrapper这几天,协助师弟们完成一些合作课题(....挺多合作的,希望他们得到锻炼的同时,也多少拿个共同作者吧...对我来说没啥用)。其中,让一个师弟尝试跑了下之前我写的差异表达分析流程,报错~~~。查了查,输入文件 ID 的大小写问题。伤心。很久很久以前,我就看差异表 ………………………………

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