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盆友,想深入理解一下信号通路里基因间的关系么?

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2019-08-20 08:20
科研要挖掘的,就是基因间的相互关系。但大多时候,你们要知道两个基因间,甚至两个信号通路间的关联,也都没什么特别好的办法。只能查查KEGG……但KEGG吧,看着跟电路图一样,我们又不是学无线电专业的,这乱七八糟的。今天夏老师给你们讲的这个神奇工具——Sign,就是用来分析信号通路间联系的:我们就随便搜一个P53:结果就是这样一个复杂的信号通路图:告诉你涉及的信号通路,以及基因信息,还有就是基因间的关系。实际上这些关联性,一是靠数据库的分析,二就是靠文献分析获得的,所以有的关联并不是那么牢靠。所以提高一点关联性分数来筛选的话,可以去掉一大批乱七八糟的Node:往下拉,下面就是这种种关联所代表的含义,比如上调P53的乙酰化 ………………………………

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