文章预览
今天给大家分享一篇超级简单的文章, 文章就做了两件事:1、识别新亚型 2、分析新亚型间差异 。看完只想说你们赶紧走出生信的舒适圈,让我进去 。 文章概述: 研究通过多组学分析识别肺腺癌驱动甲基化基因(DMGs)和相关新亚型,并阐明亚型间分子特征和临床意义。 研究过程: 首先通过MethSig和MethylMix算法识别了147个DMGs。通过相似性网络融合(SNF)方法基于DMGs的mRNA表达和甲基化数据识别了新型驱动甲基化多组学亚型S1-S4。并全面评估了它们的预后、肿瘤微环境、分子特征和治疗效果,发现S2亚型预后最差。通过与传统亚型进行比较,发现S3主要集中在proximal-infammatory(PI)亚型,而S4由terminal respiratory unit(TRU)亚型和PI亚型组成。通过分析TME和EMT特征,发现S3和S4中的免疫浸润增加,且免疫检查点基因的表达更高。而S4显示更高的EMT评分和EMT相
………………………………