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文献详解|NC带你使用单细胞与bulk转录组数据挖掘免疫治疗应答预测子

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2020-11-24 08:54
尽管免疫治疗改善了多种癌症类型的治疗前景,但是也仅有大约30%的患者在治疗后重新激活抗肿瘤免疫,而很多患者会产生免疫治疗抵抗。目前识别免疫治疗抵抗因素的研究是有限的,特别是在单细胞水平。今天要分享的这篇文章结合了单细胞与bulk转录组数据,首先从单细胞水平发现与免疫治疗抵抗相关的免疫细胞亚群,并进一步识别这些免疫细胞亚群的特征基因signature。其次在bulk数据验证了上述免疫细胞亚群signature对免疫治疗应答的预测效能,并借此开发了一个免疫治疗应答预测子(ImmuneCells.Sig),发现其具有良好的预测效能并优于其他免疫治疗应答signatures。数据与方法:研究结果1、免疫治疗抵抗相关的免疫细胞亚群基于所有免疫细胞的聚类分析,识别出了23个 ………………………………

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