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专栏名称: 生物极客
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CRISPR-Cap 使用dCas9富集特异片段

生物极客  · 公众号  · 生物  · 2019-01-18 23:19
近期在 Nucleic Acids Research 上发表了来自韩国的 CRISPR-Cap 技术,通过 Cas9富集特异的 DNA 序列,实现高达300倍以上的富集,比目前的多种富集方法都有明显的优势。对于靶向测序等有着非常重要的好处。基于PCR、杂交捕获或分子反转探针来富集基因组DNA靶区的现有方法具有各种缺点,包括实验时间长、产量和/或富集质量低。开发的CRISPR - Cap,这是一种简单且可扩展的基于CRISPR的方法,用于富集dsDNA的目标区域,只需要两个短的实验程序,两个小时就可以完成。使用CRISPR-Cap从大肠杆菌基因组DNA中平均富集10个靶基因355.7倍,最大靶上比率为81 %,富集均匀性高。使用CRISPR-Cap来测量基因拷贝数,并检测频率低至1 %的罕见等位基因。最后,还富集了人类基因组中20个基因的编码序 ………………………………

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