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Plus深读 | 单细胞DNA甲基化和染色质结构的联合分析

23Plus  · 公众号  · 生物  · 2019-08-21 07:00
传统DNA甲基化由亚硫酸氢盐全基因组测序方法(WGBS)进行,该法检测的DNA片段很短,因而对跨越远基因组距离的DNA协同甲基化的检测能力有限。近日,来自美国Ludwig癌症研究中心的Guoqiang Li等在Nature杂志的方法版块,介绍了一种能同时在单细胞中表征染色体构象和DNA甲基化组的方法(https://doi.org/10.1038/s41592-019-0502-z),研究人员将该分子方法命名为Methyl-HiC。该方法揭示了核内空间邻近的远端基因组片段之间的协同甲基化状态,并剖绘了混合类群中染色质结构和DNA甲基体的异质性。1 背景DNA是动态调节的,且因细胞形态各异。相邻的CpG的甲基化状态通常是相关的,这可由DNA甲基化可以在碱基分辨率下进行分析(WGBS)得出。由于DNA在空间上被组织成三维结构,远端基因组 ………………………………

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