Nature Methods | 阮珏/李恒合作开发更快更精准的第三代测序数据组装算法——wtdbg2

责编 | 兮 如今完成一个人的全基因组测序已经是件普通实验室甚至家庭都可以负担起费用的“平常”事情，使用第三代测序技术可以获得更完整更连续的人类基因组序列。然而在20年前，破译人类遗传密码还是极具挑战的大科学工程，当时的人类基因组测序计划与曼哈顿原子弹计划和阿波罗计划并称为三大科学计划。基因组学技术飞速进步源于测序技术的发展，同时也依赖于数据分析技术的提高。以第三代测序为例，目前完成个人全基因组测序仅需一天时间，费用也已经低于5万元。完成这样数据规模的全基因组组装分析，在2014年需要消耗50万个CPU小时，只能在超大计算机集群上进行。这种情况下，同时对大量个体进行组装分析是难以想象的，然而以全基因组组装方式 ………………………………