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LncRNA芯片的一般分析流程

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2020-01-06 22:27
前面我们系统性的总结了circRNA的相关背景知识:首先了解一下circRNA背景知识circRNA芯片分析的一般流程circRNA-seq分析的一般流程ceRNA-芯片分析的一般流程同样的策略,我们也可以应用到lncRNA的学习。所以昨天我们发布了:lncRNA的一些基础知识 ,那么接下来我们需要分享的就是lncRNA芯片的一般分析流程和lncRNA-seq数据的一般分析流程!GEO数据库里面的lncRNA芯片平台很多与circRNA芯片不同的是,GEO数据库里面的lncRNA芯片平台很多,毕竟已经是三五年前的热点了。如果按照使用量排序,可以看到其实也就几百个数据集而已。感兴趣的朋友可以点击进入查看详情。每个芯片平台的主页内容都是非常丰富的。通常lncRNA芯片只有探针序列比如:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL16956 ,如下所示,有一百多个数据集都是使用的这个平台的芯片,但是可以看到 ………………………………

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