安装JCVI最难事情居然是安装LaTex!还好,Latex安装不需要root权限使用conda安装conda create -y -c bioconda -n jcvi jcvi 使用时需要启动环境conda activate jcvi在此基础上可以更新到最新版的JCVI (Github版本会不断的增加新功能并修订bug)pip install git+git://github.com/tanghaibao/jcvi.git安装额外的依赖环境Kent toolsBEDTOOLSEMBOSSLASTLaTex依赖环境中,BEDTOOLS, EMBOSS和LAST可以用conda安装# BEDTOOLS 和 EMBOSSconda install -y -n jcvi -c bioconda bedtools emboss lastKent tools需要编译, 并且依赖MySQL,暂时不需要安装。# Kent tools, 134Mwget http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/jksrc.zip unzip jksrc.zipcd kent/src/libmake 对于Latex,conda的安装版本 ( texlive-core )在我后续的测试中各种出问题, 我最后根据根据官方的quickinstall.html 进
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