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基因组共线性知多少?

生信百科  · 公众号  · 医学  · 2017-10-16 10:00
不同基因组之间在大小和数目上存在较大差异,比如,拟南芥基因大约100Mb, 而杨树基因组450Mb, 又大豆基因组1.2Gb。但是对于物种的特有基因进行研究却发现数目非常少,也就是基因组之间基因的种类差异很小。这是因为大多数物种,尤其是植物转座子序列很多。除此之外,植物基因组在进化过程中还经常发生染色体加倍现象。       即使基因组如何变化,在基因组上的基因总会存在一定的顺序,通过同源性比对的方法,总会找到基因组之间有多组基因数量及顺序相对保守,例如,拟南芥(双子叶植物)和水稻(单子叶植物)是由2亿年前的共同祖先分枝进化而来的,但两个物种仍可检测到尽管比较低的共线性。柳树与杨树60%的基因存在共线性,因为两者有最近 ………………………………

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