分析方法|单细胞测序之细胞互作

今年张泽民团队与其合作团队在Cell发表的一篇文章将细胞交互运用自如【1】，该研究手段值得借鉴。肿瘤微环境由很多细胞类型组成，每一种细胞类型的异质性，如肿瘤细胞的不同克隆或免疫细胞的不同亚群，进一步增加了肿瘤微环境的复杂性。不同细胞类型的通讯广泛参与肿瘤的发生与发展、免疫浸润、免疫逃逸、炎性等多种生物学机制。该文章构建了细胞-细胞交互网络，定义了调控肿瘤生成与抗肿瘤免疫的关键细胞群体，发现特异的肿瘤相关巨噬细胞与树突状细胞群体是细胞交互网络中的hub节点（网络枢纽，连接不同的细胞群体）。推荐这篇文章的主要原因是其采用了两种方法去层层递进解析细胞交互，并且这两种方法都可以推广到单细胞数据的不同癌症类型 ………………………………