手把手教学系统进化树构建

一、系统进化树（phylogenetic tree）具有共同祖先的各物种/类群相互间演化关系的树，又被译作系统发育树、系统演化树、系统发生树、种系发生树、系统树等。 二、为什么要构建系统进化树？1. 推测进化模型。从进化树拓扑结构和枝长中推测背后的进化机制。 2. 预测。模型体现的是机制，机制清楚了，就可以对关键位置进行预测。三、构建系统进化树常用的方法    1. 基于距离：      UPGMA（类平均法）      ME（Minimum Evolution，最小进化法）      NJ（Neighbor-Joining，邻接法）    2.基于特征：      MP（Maximum parsimony，最大简约法）      ML（Maximum likelihood，最大似然法）      Bayesian Inference (BI，贝叶斯方法）         （通常用两种以上方 ………………………………