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为何甲基化水平和基因表达水平相关性弱?李蔚团队开发可以校正测序数据中细胞异质性的甲基化水平定量算法

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2021-01-26 08:23
责编 | 酶美DNA甲基化修饰 (DNA methylation) 是一类不改变DNA序列的表观遗传修饰 (epigenetic modification)。在人类基因组中,DNA甲基化主要发生在CpG位点中的胞嘧啶 (cytosine) 上,具有抑制转录表达,参与基因组印记 (genomic imprinting) 以及调控染色体结构的作用。近几十年来,基于启动子附近CpG 岛 (promoter CpG island) 的甲基化研究揭示出甲基化CpG (mCpG) 经 methyl-CpG-binding domain (MBD) 蛋白家族读取后能够招募组蛋白去乙酰化酶 (histone deacetylase complexes) 来抑制基因的表达。尽管大量实验表明启动子附近CpG 岛的甲基化水平与基因表达水平应具有很强的负相关性,但是基于甲基化测序技术的研究却发现两者之间负相关性相对较弱。 美国加州大学尔湾分校李蔚教授团队,徐建锋、史偈君等研 ………………………………

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