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[原创]Linux学习-常见错误和快捷操作

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2020-02-26 08:20

Linux下命令的一些异常情况

命令不全:在命令没有输入完 (引号或括号没有配对),就不小心按下了Enter键,终端会提示出一个>代表命令不完整,这是可以继续输入,也可以ctrl+c终止输入,重新再来。(下面sed命令使用时,还有另外一种命令不全的问题)

ct@ehbio:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2
>'

ct@ehbio:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2
> ^C
ct@ehbio:~/ehbio_project$

文件名输入错误: 多一个字母、少一个字母、大小写问题

ct@ehbio:~/ehbio_project$ls
ehbio2.fa  ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio.fa  second.fa

# 重命名没有生效
ct@ehbio:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2' 'ehbio5' ebio2.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio2.fa  ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio.fa  second.fa

# 仔细看是ehbio2.fa写成了ebio2.fa,更正后即可。
Z8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2' 'ehbio5' ehbio2.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio.fa  second.fa

所在目录不对: 访问的文件不存在于当前目录,而又没有提供绝对路径, 或软连接失效

ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls ../data
ehbio2.fa  first.fa

# 当前目录没有ehbio2.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ less ehbio2.fa
ehbio2.fa: 没有那个文件或目录

# ehbio2.fa在上一层目录的data目录下
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls ../data/ehbio2.fa
../data/ehbio2.fa

# 加上路径依然访问不了
ct@ehbio:~/ehbio_project$ less ../data/ehbio2.fa
../data/ehbio2.fa: 没有那个文件或目录

# 上面的问题是软连接失效,在之前的操作中删掉了原始的ehbio2.fa,所以快捷方式失效

# 正确的访问
ct@ehbio:~/ehbio_project$ tail -n 3 ../data/first.fa
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
end

Linux终端常用快捷操作

  • 命令或文件名自动补全:在输入命令或文件名的前几个字母后,按Tab键,系统会自动补全或提示补全

  • 上下箭头:使用上下箭头可以回溯之前的命令,增加命令的重用,减少输入工作量

  • !加之前输入过的命令的前几个字母,快速获取前面的命令

ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
end
ct@ehbio:~/ehbio_project$ man cut
# 直接跳到上面运行的cut命令,再执行一次
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !cut
cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
end
  • ctrl+a回到命令的行首,用于修改常命令或注释掉命令

# 写完下面的命令,突然不想运行了,又不想一个个删掉
ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4

# 按ctrl+a, 回到行首,再输入`#`号,回车,命令即被注释掉。
ct@ehbio:~/ehbio_project$ #cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4
  • !! 表示上一条命令。

ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !!
ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa
  • 替换上一个命令中的字符,再运行一遍命令,用于需要对多个文件执行同样的命令,又不想写循环的情况

# 输入一个命令
ct@ehbio:~/ehbio_project$ #cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4

# !!表示上一条命令
# :gs表示替换,把上一个命令中全部的ehbio替换为ehbio3; g: global; s: substitute
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !!:gs/ehbio/ehbio3
#cut -f 1 -d ' ' ehbio3.fa | tail -n 4

# 替换后效果如上

# 去掉命令前的#号
ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d ' ' ehbio3.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
end

## 替换ehbio3为ehbio4,直接运行命令
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !!:gs/ehbio3/ehbio4
cut -f 1 -d ' ' ehbio4.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA

end


  1. PATH和path,傻傻分不清

  2. 耗时很长的程序忘加nohup就运行了怎么办?

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