155个GPU！多云场景下的Amber自由能计算

在上一篇生信云实证《提速2920倍！用AutoDock Vina对接2800万个分子》里，我们基于不同用户策略，调用10万核CPU资源，帮用户进行了2800万量级的大规模分子对接，将运算效率提高2920倍。对药物分子的虚拟筛选，仅仅实现分子对接是不够的，往往会面临一个问题就是药物分子活性的评价。许多药物和其它生物分子的活性都是通过与受体大分子之间的相互作用表现出来的，是动态的。受体和配体之间结合自由能（Binding Afinity）评价是基于结构的计算机辅助药物分子设计的核心问题。基于分子动力学（Molecular Dynamics, MD）模拟的炼金术自由能（Alchemical Free Energy，AFE）计算是提高我们对各种生物过程的理解以及加快多种疾病的药物设计和优化的关键工具。MD模拟实验数据量大，计 ………………………………