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点击蓝字“代谢组metabolome”，轻松关注不迷路生科云网址：https://www.bioincloud.tech/α和 β多样性分析主要用qiime2插件完成。α多样性分析包括稀释性曲线，α多样性指数计算及α多样性指数的组间显著性差异比较。α多样性指数是对某个样品中物种多样性的分析，包含样品中的物种组成的丰富度和均匀度两个因素。比如Observed OTU指数是指样本中实际测定得到的OTU数量，衡量样品中OTU丰富度的指数；Shannon指数为多样性指数，它的计算考虑到样品中的分类总数，和每个分类所占的比例；Faith's Phylogenetic Diversity是基于系统发生树来计算的一种多样性指数；chao1指数是用来反映物种丰富度 (物种的种类数量) 的指标，它通过观测到的结果推算出一个理论的丰富度。注：在扩增子测序中，singleton通常是由于测序错误造成的，只会带来噪音，qiime2流程得到的OTU表通 ………………………………