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TCGA又来了：根据AJCC分期绘制某基因表达的箱线图

挑圈联靠  · 公众号  ·  · 2020-11-29 10:55
年前的TCGA单元课已经过了一段时间了。课程做完后老师和我说，TCGA的内容和应用都很丰富的，这份课件已经有89页的细致讲解，但仍然感觉还有很多地方要学习……真是渺沧海之一粟呀。这不，有位学员拿篇文章（PMID：27852524）来问我们，Fig 1f中，根据AJCC的分期画箱线图用R怎么做。这一看，很像GraphPad Prism做的嘛~再一看文章，貌似还是真。要用R也可以呀~不过文中又没提到这TCGA数据是通过什么途径获取的，版本等一些关键信息都没有，让我们纠结了好久……那就试试这种图的做法吧，但不保证能精确重复出这张图吼~说到这里，我弱弱地说一句，以后你们写文章可不可以不要这么省笔墨呀，“材料和方法”这个章节的存在不就是为了让人知道你的研究是怎么做出来的 ………………………………

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