今天给大家分享一篇肿瘤内微生物组的多组学生信分析文章,文章通过整合微生物组学、转录物组学、蛋白质组学和单细胞数据,基于肿瘤内微生物组衍生的糖酵解-乳酸特征描述了肺腺癌的免疫异质性。这篇文章2023年8月17日发表在Frontiers in Microbiology(中科院2区, IF=5.2)上:PART.01研究背景微生物组在肺腺癌(LUAD)的发展和抗肿瘤治疗效果中发挥着作用。肿瘤中的糖酵解异常可能会促进乳酸生成,从而改变肿瘤微环境,影响微生物组、癌细胞和免疫细胞。这篇文章的目的是构建肿瘤内微生物组评分来预测LUAD患者的预后,并深入研究糖酵解和乳酸特征与LUAD免疫细胞浸润的关系。PART.02研究内容首先从TCGA,GEO数据库和文献中获取微生物组,蛋白组,单细胞和RNA测序的数据。作者基于微生物组的数据构建了肺内微生物评分(LMS),并把LMS评分与临床指标
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