哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 （八）

哈佛大学单细胞课程|笔记汇总 （七）哈佛大学刘小乐教授讲授的计算生物学和生物信息学导论 (2020 视频+资料）（八）Single-cell RNA-seq clustering analysis得到高质量的细胞后，我们可以探究细胞群中的不同细胞类型。Exploration of quality control metrics为了确定我们的细胞亚群是否可能是由于诸如细胞周期阶段或线粒体表达之类的假象引起的，可以对不同cluster之间进行多种可视化分析判断影响因素。这里我们将调用DimPlot()和FeaturePlot()函数来分析并可视化多种质控指标。按照样本对细胞亚群进行分离从探索每个样品中不同细胞亚群开始分析：# 从Seurat对象中提取身份和样本信息，以确定每个样本的每个簇的细胞数n_cells vars = c("ident", "orig.ident")) %>% dplyr::count(iden ………………………………