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3.998分的SCI Rep,教你不用ggplot也能做出漂亮的火山图……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2021-01-13 07:28
相信你们要是做生信类文章的话,都知道火山图,没错,之前夏老师就是用Excel来做的:这个文件我都不知道撇哪儿去了,阈值线什么的也都要自己画……现在好了,突然某天夏老师看了一篇Sci Rep (IF: 3.998),发现了能制作火山图的工具……其实功能就都有够简单,直接导入CSV就可以了……(当然是你经过差异表达分析的CSV,不要随便搞了点芯片数据,就当能用了)当然,你也可以调整X轴和Y轴的数据,但基本上都是-Log10的p值和Log2的变化倍数:直接点Plot的菜单栏就可以形成基本的火山图了,上面还给你们标注了基因名:简直就是没有任何技术含量……唉……拉动阈值调节的Filter,就能调整高低表达的基因的范围:点击到Node上,也会显示具体的基因数据:最后调整后, ………………………………

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