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MicrobiomeAnalyst | 零代码分析宏基因组数据

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2020-08-09 17:30
MicrobiomeAnalyst 是一个方便易用的宏基因组数据分析网站,它可以使没有生物信息学研究背景的研究人员和临床医生通过可视化界面自由探索微生物组数据,包括数据预处理、统计分析、功能分析以及挖掘公共数据集。MicrobiomeAnalyst 的分析流程主要包含四个模块:1.标记基因数据分析 (MDP) ,用于分析标记基因数据;2.宏基因组数据分析 (SDP) ,用于分析宏基因组鸟枪法测序数据;3.探索公共数据库 (PPD) ,用于将标记基因数据与公共数据集进行可视化比较;4.物种富集分析 (TSEA) ,用于检验 OTU 表中是否富集某些预定义的物种集。这四个模块共享相同的通用工作流程:数据预处理、数据分析和可视化探索。在数据预处理阶段,主要对数据进行质控过滤和标准化;下一步,对处 ………………………………

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