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干货 | 常用microRNA靶基因预测工具

解螺旋  · 公众号  · 医学  · 2019-04-05 18:31
解螺旋公众号·陪伴你科研的第1807天miRNA才是科研的新手之友。MicroRNA研究是一直国内外研究的热点领域,每年都有大量的microRNA相关文章发表或相关基金申请,而microRNA功能研究最重要的是其靶基因的确认,荷叶今天给大家介绍一些常见的microRNA靶基因预测工具。1TargetScan网址:新版 http://www.targetscan.org/vert_72/老版 http://www.targetscan.org/mamm_31/TargetScan用起来很简单方便,输入基因名能查出某个基因3’UTR可能的作用多个microRNA。最新版的TargetScan还人性化的列出目前发现的多种3’UTR。输入microRNA名则能查出某个microRNA可能作用的多种靶基因。图1 TargetScan网站中查找目标基因的候选miRNA图2 TargetScan网站中查找目标miRNA的候选靶基因2miRcode网址: http://www.mircode.org/index.phpmiRcode与TargetS ………………………………

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