23+Circulation|一篇经典的单细胞思路

Hello,大家好呀，今天和大家分享一篇最近发表在Circulation(IF:23)上的单细胞测序文章思路，感兴趣的小伙伴可以竖起耳朵喽！美国Baylor医学院的Ying H. Shen 团队采用单细胞转录组测序技术对人类降主动脉血管壁进行分析，综合描述了升主动脉瘤中分子特征，该结果发表于心血管领域顶级期刊《Circulation》中，题目为“Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Dynamic Cell Populations and Differential Gene Expression Patterns in Control and Aneurysmal Human Aortic Tissue”首先对于我这种单细胞小白，我一般会用R语言来进行分析，原因也很简单，Seurat真的很不错呢！下图来自运来兄，从图中我们可以看出整个Seurat的经典分析思路，分别是数据读--均一化和标准化—特征选择与提取—聚类—差异分析—可视化降维 ………………………………