Nat Commun | 变废为宝！冯智星团队合作发布大规模挖掘纳米孔测序数据的关键算法LongBow，赋能大数据精准挖掘

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纳米孔测序技术凭借其长读长、可直接检测碱基修饰以及实时测序等优势，正在深刻改变生命科学与医学研究的格局。然而，在目前公开的超70万组数据中，约85%因缺乏关键元数据——特别是测序芯片类型与碱基识别配置信息——而成为难以有效利用的“僵尸数据”。 近日，上海交通大学医学院附属新华医院 冯智星 、 余永国 、 孙锟 教授与复旦大学生命科学学院 冯会娟 青年研究员在 Nature Communication 发表最新研究成果： Restoring flowcell type and basecaller configuration from FASTQ files of nanopore sequencing data 。研究团队合作开发的LongBow算法成功破解了这一技术难题。该创新算法仅需通过FASTQ文件中的质量值 （QV） 即可精准还原测序芯片类型与碱基识别配置信息。经多类样本测试验证，LongBow的识别准确率超过95%。研究团队还同步构建了配套数据库LongBowDB，为科 ………………………………