上海辰山植物园杨俊/王红霞团队合作在《Nature Communications》上发表文章

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2024年5月14日，上海交通大学生命科学技术学院余祥长聘教轨副教授课题组和上海辰山植物园杨俊/王红霞团队合作在国际知名期刊《Nature Communications》发表题为“Transfer learning enables identification of multiple types of RNA modifications using nanopore direct RNA sequencing”的研究论文。作者结合纳米孔RNA直接测序技术和深度学习方法开发了可同时检测多种类型RNA修饰的迁移学习模型TandemMod（图1）。上海交通大学生命科学技术学院博士后吴优为论文第一作者，上海交通大学生命科学技术学院余祥长聘教轨副教授、辰山植物园王红霞副研究员和杨俊研究员为该论文通讯作者。 图1. 基于纳米孔RNA直接测序数据搭建TandemMod深度学习框架的示意图。 自然界RNA中存在160种以上的修饰类型。近年的研究揭示mRNA上的m 6 A、m 5 C、m 1 A和Ψ等修饰具有重要的生物学功能。结合抗体捕获、化 ………………………………