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Sci Adv|山东大学常文强等:融合潜在扩散模型与MD设计新型抗菌肽

智药邦  · 公众号  ·  · 2025-03-14 08:00
    

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世界卫生组织预测,到2050年,抗生素耐药性感染可能导致每年1000万人死亡,超越癌症成为人类健康的首要威胁。随着抗生素滥用导致的耐药性问题日益严重,开发新型抗菌药物已成为当务之急。 在此背景下,抗菌肽(Antimicrobial Peptides,AMPs)因其广谱抗菌活性和低耐药性特征,被视为下一代抗感染药物的希望之星。然而,传统设计方法受限于化学空间的庞杂性,难以高效探索新型AMPs。 现有AI生成模型虽能加速肽序列设计,却面临两大瓶颈: 生成序列多样性不足 (相似度普遍高于0.7), 且抗真菌肽研究几乎空白 。 针对这一挑战,山东大学药学院常文强团队创新性地将潜在扩散模型(Latent Diffusion Model,LDM)与分子动力学模拟结合,开发出AMP设计新范式。实验显示,该方法生成的肽序列相似度低至0.5686,其中AMP-29对耐药性白色念珠菌的抑制浓度(M ………………………………

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