PacBio下机数据介绍

三代数据解读三代测序又被称为单分子实时DNA测序，采取纳米孔的单分子读取技术，相较之前测序技术，其优势为：读长长（20 Kb文库通常平均长度能达到8 Kb以上，如果DNA提取质量很高平均长度可以达到10 Kb以上），最长读长可以达到40 Kb~70 Kb左右；无需进行PCR扩增，避免reads复制比例（二代文库通常会出现复制比例偏高，覆盖度不均匀的情况）；避免GC偏好性，高GC区域可以轻松测出来，对于那些高GC或低GC物种保证从头组装基因组的可靠性。好了废话不多说，进入今天主题.一.数据下机结果评估1) RSII数据下机后会有一个质控报告，小编作为一个分析人员，比较关注的点有1、SMRT Cells测了几个cell；2、Mean Read Length的平均长度，长度过短可以说明这个文库构建失败了； ………………………………