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病原体突变,尤其是像SARS-CoV-2这样的病毒突变,持续对开发有效且持久的抗病毒疗法构成重大阻碍。 前天,东京科学研究所Yoshinori Fujiyoshi通讯在《Proceedings of the National Academy of Sciences》发表论文“ Structure-guided engineering of a mutation-tolerant inhibitor peptide against variable SARS-CoV-2 spikes ”,报道了针对SARS-CoV-2刺突蛋白进行结构导向工程设计抑制肽CeSPIACE的研究。 作者利用高分辨率结构信息和结合试验设计了CeSPIACE。通过参考LCB1的RBD结合部分,确定了一个39个氨基酸的肽段区域,并对其进行修饰以增强结构稳定性和突变耐受性。该肽形成双螺旋束并同源二聚化,其RBD结合位点向外。引入特定的相互作用,如盐桥和阳离子-π相互作用,可稳定螺旋束并增加对RBD的亲和力,尽管这些相互作用并不直接与RBD相互作用。这种创新设计为CeSPIACE的独特特性奠定了基础。
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