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生信不用学代码!你需要这个中文版TCGA

弗雷赛斯  · 公众号  · 科研  · 2021-05-28 21:38
近期,临床生信之家在功能和界面上都有了彻底的升级,这里我们将不同公开数据库以及代表性的功能分析划分为独立模块,如图,同时也可以去交流区去互动或者视频教程区观看教程,后续会将一起其他公共数据库整合进来,如CCLE,TARGET等。第一个是TCGA数据库(The cancer genome atlas,癌症基因组图谱), 收录了各种人类癌症(包括亚型在内的肿瘤)的临床数据,基因组变异,mRNA表达,miRNA表达,甲基化等数据,是癌症研究者很重要的数据来源。在这里我们对TCGA数据库所有33种肿瘤进行可视化分析,既可以根据特定临床信息、某基因突变或表达量高低进行样本筛选,也可以根据分析类型分为单组,多组,复杂分析。第二个是GEO数据库(GENE EXPRESSION OMNIBUS),收录了世界 ………………………………

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