Cell子刊 | 浙江大学王毅等合作开发新的方法，鉴定药物反应性细胞群

文章预览

编者按 由于细胞 群的异质性，细胞对药物的反应存在差异。因此，鉴定药物反应性细胞群对于准确阐明药物作用机制至关重要，这仍然是一个巨大的挑战。 2024年5月15日，浙江大学王毅、Shao Xin及天津中医药大学范骁辉共同通讯在 Cell Reports Medicine   在线发表题为 “ scRank infers drug-responsive cell types from untreated scRNA-seq data using a target-perturbed gene regulatory network ” 的研究论文， 该研究表明scRank利用靶干扰基因调控网络，从未经处理的scRNA-seq数据推断药物反应性细胞类型。 该研究用scRank解决了这个问题，scRank采用靶标扰动基因调控网络，利用未经处理的单细胞转录组数据，通过计算机药物扰动对药物反应性细胞群进行排序。 在模拟和真实数据集上对scRank进行了基准测试，结果表明scRank优于现有方法。当应用于成神经管细胞瘤和重度抑郁症数据集时，scRan ………………………………