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自FDA于1977 年批准首款口服小分子肿瘤靶向药——靶向雌激素受体(ER)的他莫昔芬用于治疗乳腺癌后,小分子药物开发通常聚焦于筛选高亲和力的抑制剂。小分子抑制剂可和蛋白的活性位点或变构位点结合,以废除该蛋白的功能。然而,小分子抑制剂往往面临两大挑战:一方面,对小分子抑制剂响应的患者最终还是会发生耐药,主要是由耐药突变导致;另一方面,“占据驱动”模式要求其靶蛋白上具有可被小分子“占据”的明确的口袋/沟槽,而部分蛋白口袋/沟槽非常浅,甚至缺乏催化区域,导致小分子抑制剂的效果不甚理想。这些靶蛋白通常也被称为难以成药的靶点。 据统计,有三类蛋白难以开发小分子抑制剂:一是以蛋白复合体形式发挥作用 的靶蛋白; 二是具有脚手架功能(Scaffold)的靶蛋白; 三是同源基因众多的靶蛋白。 根据2017 年NRDD
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