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理论上处理10x技术的单细胞转录组数据应该是毫无悬念了,因为太大众了所以到处是教程。但有些时候会被作者不小心埋下的雷给坑一下,比如这个人类膀胱癌数据集GSE181294明明写的是 hromium Single Cell 3’ Library and Gel Bead Kit v2 (10X Genomics). 但是读取就会失败,让我们拆解一下这个过程。 数据集是:GSE181294 451K 5 12 2022 GSM6133917_S1.barcode.csv.gz 40M 5 12 2022 GSM6133917_S1.counts.mtx.gz 72K 5 12 2022 GSM6133917_S1.genes.csv.gz 462K 5 12 2022 GSM6133918_S2.barcode.csv.gz 46M 5 12 2022 GSM6133918_S2.counts.mtx.gz 72K 5 12 2022 GSM6133918_S2.genes.csv.gz 。。。。 让人工智能大模型进行文件解释: 10x Genomics平台进行单细胞RNA测序时,会生成几种特定格式的文件,每种文件包含不同类型的数据。以下是您提供的文件名及其含义的解释: **Barcode文件 ( .barcode.cs
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