新课第三期 | 单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源

主要观点总结

文章介绍了关于微生物全基因组测序的课程内容和适用范围，包括单菌基因组的组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源等方面的内容。课程涵盖细菌、病毒和真菌的基因组分析，旨在帮助微生物学、进化生物学、传染病学等领域的学生和研究人员提升专业技能。课程内容还包括原理与实操，提供计算平台、课件、流程代码等资源和模式。

关键观点总结

关键观点1: 课程内容和适用范围

课程涵盖全基因组测序数据的组装、注释、遗传表征等分析流程，旨在研究单个微生物物种的特征菌株或病原体毒株基因组。课程内容适用于微生物学、进化生物学、传染病学等领域的研究人员。

关键观点2: 课程特色

课程中原理与实操并重，提供计算平台、课件、流程代码、生信软件等资源，帮助学员快速部署流程，熟悉操作方法，强化编程技能，完善理论学习，提升专业技能。

关键观点3: 适用人群

本课程适用于微生物学、进化生物学、传染病学等领域的学生和研究人员，也适用于微生物实验室/课题组建立系统的基因组分析流程，完善质量管理体系。

关键观点4: 课程安排和资源

课程采用理论与实操相结合的方式，每节课1小时一个主题。提供配套数据库、课程直播、视频回看和答疑群等资源。课程提供搭建好的单菌基因组分析流程，主要基于Linux系统、R语言和部分Python脚本。

文章预览

单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源 福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、单物种转录组、单菌基因组的线上/线下同时开课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课 。期待和大家的线上线下会晤。 目前可以通报的信息： 单物种转录组线上/线下开课时间： 2025/08/22-23 临床基因组线上/线下开课时间： 2025/5/16-18 单菌基因组线上/线下开课时间： 2025/5/23-25 宏基因组线上/线下开课时间： 2025/10/18-19 扩增子线上/线下开课时间： 2025/11/15-16 报名链接：http://www.ehbio.com/Training/ 开课背景 微生物 (细菌、病毒和真菌)的全基因组测序 (Whole genome sequencing, WGS)技术已取得了长足的进步，可通过足够低的成本、可观的通量和较短的时间完 ………………………………