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iMeta | 福农朱方捷/王琴组揭示TFs解决“特异性悖论”的新机制

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2025-03-13 21:00
    

主要观点总结

福建农林大学的研究团队利用高通量SELEX技术解析了R2R3-MYB转录因子对DNA序列的识别特性,揭示了旁系同源TFs通过同源二聚化实现靶向特异性的新机制。研究涉及40个R2R3-MYBs的DNA序列特异性数据集,并提供了迄今为止最大规模的植物TF二聚体序列特异性数据集。研究结果表明,同源二聚化可以改变转录因子的序列特异性,使其能够识别独特的顺式元件序列,从而靶向独特的下游基因,实现与同家族其他TFs的差异转录调控。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景及目的

转录因子是调节基因表达的关键,在进化过程中,许多转录因子家族经历了基因复制和功能分化,导致复杂的转录调控网络。本研究旨在解析R2R3-MYB转录因子对DNA序列的识别特性,揭示其解决‘特异性悖论’的新机制。

关键观点2: 研究方法

利用高通量SELEX技术解析了40个R2R3-MYBs识别的DNA序列,通过数据分析揭示了一种TFs解决‘特异性悖论’的新机制。

关键观点3: 研究结果

发现了旁系同源TFs通过同源二聚化实现靶向特异性的新机制。揭示了迄今为止最大规模的植物SELEX数据集,包括833个单体及二聚体MYB结合基序。鉴定到一类高特异性的CCWAA-box MYB转录因子簇。

关键观点4: 研究亮点

揭示了同源二聚化改变序列特异性的机制,为理解转录因子的功能提供了新的视角。研究结果表明,编辑同源二聚体CREs可能为精准调控旁系同源TFs中特定成员的下游靶基因表达提供新思路。


文章预览

转录因子(Transcription factors,TFs)作为调节基因定时、定点、定量表达的“开关”,是信号转导网络的枢纽,也是决定细胞命运的关键。在进化历程中,许多转录因子家族经历了基因复制、成员扩张、功能分化,产生大量旁系同源(Paralogous)转录因子,使转录调控网络复杂性不断提高,进而使高等动植物具有更强的环境适应性。然而,令人困惑的是许多 旁系同源TFs识别的DNA序列高度相似,却具有截然不同的生理功能——这一现象被称为TF的“特异性悖论 ”。 近期,福建农林大学海峡联合研究院朱方捷教授团队与王琴教授团队利用高通量SELEX(HT-SELEX)技术解析了40个R2R3-MYBs识别的DNA序列,提供了最系统的MYB家族转录因子特异性数据集,以及迄今最大规模的植物TF二聚体序列特异性数据集,并通过数据分析,揭示了一种TFs解决“特异性悖论”的新机 ………………………………

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