GigaScience | 超快速VCF2Dis: 大规模遗传距离与群体系统发育进化树构建的新利器

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超快速VCF2Dis 近日，南通大学第二附属医院、深圳华大生命科学研究院和三亚华大生命科学研究院联合，在《GigaScience》上发表题为“VCF2Dis: an ultra-fast and efficient tool to calculate pairwise genetic distance and construct population phylogeny from VCF files”的研究论文。该研究开发了一款超快速且高效的工具VCF2Dis，能够直接从大规模VCF文件中计算成对遗传距离并构建种群系统发育树。这一成果不仅为基因组学研究提供了强大的分析工具，也为种群遗传学和进化生物学领域的创新研究奠定了重要基础。 随着测序技术进步和成本下降，大规模基因组测序项目（如千人基因组计划）产生了海量VCF格式遗传变异数据。如何高效、准确地计算遗传距离并构建系统发育树，成为群体遗传学研究的一大挑战。现有工具如IQ-TREE需依赖格式转换，基于比对的方法计算量大，难以处理大规 ………………………………