Science子刊 | 东南大学姚红红等团队通过多组学方法，表征缺血小鼠脑的分子和细胞结构

iNature 神经炎症被认为是脑缺血后的一个关键病理事件。然而，对非神经细胞的分子和空间特征以及在缺血性脑中不同细胞类型之间的相互作用的了解还很有限。2024年2月7日，东南大学姚红红和南京航空航天大学王杰共同通讯在Science Translational Medicine 在线发表题为“Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize the molecular and cellular architecture of the ischemic mouse brain”的研究论文，该研究用空间转录组学来检测中风后小鼠的缺血半球，并对19,777个位置的转录组进行了测序，从而使我们能够可视化组织内的转录景观，并确定与特定组织学实体相关的基因表达谱。通过单细胞RNA测序确定的细胞类型确认并丰富了缺血半球的周梗死区域与基因表达的空间标注。对细胞通信中的配体-受体相互作用的分析揭示了半乳糖凝集素9与细胞表面糖蛋白CD44（LGALS9-CD44 ………………………………