Modeller文档学习笔记

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c此笔记暂未完成，完整更新请关注阅读原文或者查看Modeller文档 0. 安装 建议使用conda安装 conda config --add channels salilab conda install modeller 之后在按照cmd上的提示编辑相应文件写入授权 1. 介绍 Modeller是一个蛋白三维建模的软件，其在学术上是免费的，但是商业上是收费的。其一般用于同源建模或者三维结构比较，许多计算软件如Discovery Studio，薛定谔，Model都内置了该软件。 当然其也可以进行限制配体建模，结合NMR实验进行建模等等，截止笔记时其版本为10.0，目前已经可以使用Python3.X脚本进行执行，原来的mod9.x的内置Python运行脚本方式已经被弃用了。 1.1 方法简介 模板3D结构迭代进入靶标 约束某些参数，如C alpha -C alpha 距离，氢键等等 3D建模所有满足的可能性 2. 使用 ………………………………