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Cell | 肠道微生物定植的保守遗传基础

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2025-05-25 21:00
    

主要观点总结

本文研究了肠道微生物的定植遗传基础,通过跨物种基因型-生态位关联分析,识别了与肠道定植相关的保守微生物基因模块,发现了79个假定的定植因子,包括已知的定植途径如autoinducer-2生物合成,以及新的过程如tRNA修饰和翻译。体内功能验证表明,YigZ和tRNA羟化蛋白-p是大肠杆菌肠道定植所必需的。这些广泛保守的定植因子对理解胃肠道失调和开发治疗药物至关重要。

关键观点总结

关键观点1: 肠道微生物的定植遗传基础

本文研究了肠道微生物的定植遗传基础,通过跨物种基因型-生态位关联分析,识别了与肠道定植相关的保守微生物基因模块。

关键观点2: 假定的定植因子

本文发现了79个假定的定植因子,包括已知的定植途径如autoinducer-2生物合成,以及新的过程如tRNA修饰和翻译。

关键观点3: 体内功能验证

体内功能验证表明,YigZ和tRNA羟化蛋白-p是大肠杆菌肠道定植所必需的。

关键观点4: 定植因子的重要性

这些广泛保守的定植因子对理解胃肠道失调和开发治疗药物至关重要。


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研究论文 ● 期刊: Cell  (IF:45.5) ● DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.03.010 ● 原文链接: https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)00283-1 ● 第一作者:Menghan Liu ● 通讯作者:Saeed Tavazoie( st2744@columbia.edu ) ● 发表日期:2025-4-4 ● 主要单位: 哥伦比亚大学、洛克菲勒大学、西奈山伊坎医学院 摘要Abstract 尽管肠道微生物十分重要,但其定植的遗传基础仍有许多未被探索。在此,通过在生命之树尺度上应用跨物种基因型-生态位关联分析,我们识别出与肠道定植相关的保守微生物基因模块。在数千个物种中,我们发现了79个分类学上多样化的假定定植因子,它们被组织成操纵子和非操纵子模块。它们包括先前已鉴定的定植途径,如autoinducer-2生物合成以及包括tRNA修饰和翻译在内的新过程。体内功能验证表明,YigZ(IMpACT家族)和tRNA羟化蛋白-p(Trhp)是大肠杆菌 ………………………………

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