GEO数据库实操、三大芯片

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学习笔记总结于『生信技能树』马拉松课程 GEO数据挖掘系列，第7篇学习笔记：GEO数据库实操、三大芯片介绍 一、GEO数据库实操 1.点击Series 图1 2.点击图5红框内容，使网页中只显示芯片的结果，而不显示高通量测序等等其他技术的结果；红框右边一列是物种，也可用来筛选 other 是不同于芯片、高通量测序等等的其他类型，可能是最新技术 图2 3.此时再搜关键词 图3 4.点击任意一个芯片GSE，拉到网页最下面 图4 5.如果在GEO数据库中直接搜索到的结果较少，可在网站 pubmed 中搜索，记得加上一些关键词 图5 别人用过的数据，我们同样可以拿来使用，也不用担心数据的年代过于久远 二、基因表达量芯片的数据形式 表达量芯片是一种常用的基因表达测量技术，它可以同时测量成千上万个基因的表达水平。本文对三大芯片公司（Affymetrix、Agilent和Illumina）常用 ………………………………