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重要降维分析方法PCA、Bray-Curtis PCoA和 Bray-Curtis NMDS分析你会了吗?视频教程看一下!

代谢组metabolome  · 公众号  ·  · 2023-05-08 08:00
点击蓝字“代谢组metabolome”,轻松关注不迷路生科云网址:https://www.bioincloud.tech/微科盟生科云 (https://www.bioincloud.tech) 旨在帮助客户简化分析流程,助力科研的基础上,不仅开发了全自动化的一键式批量宏基因组数据分析流程,还开发了单个分析小程序,可大大方便客户灵活分析。  PCA、Bray-Curtis PCoA和Bray-Curtis NMDS分析是一类适用于生态学研究的重要降维分析方法。其中,PCA(基于欧式距离的PCoA)是基于线型模型的一种降维分析,它应用方差分解的方法对多维数据进行降维,从而提取出数据中最主要的元素和结构, PCA 能够提取出最大程度反映样品间差异的两个坐标轴,从而将多维数据的差异反映在二维坐标图上,进而揭示复杂数据背景下的简单规律。    Bray-Curtis NMDS是非线性模型,更好地反映生态学数据的非线性结构,可根据样本中包含的 ………………………………

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